一般来说，根系的定性研究满足不了学科领域的要求，早期的根系定量研究是用根系重量来表示根的总量，但是研究表明，根系的表面积或者总长度比根的重量更能反映植物对水分和无机盐的吸收能力。而单位体积土壤中根的总长度是个重量参数，但是要精确测定根系的总长度并不是一件很简单的事，下面内容通过植物根系分析系统研究定量测试根系的两个困难。
1、首先根系的总长度很大，即使体积很小的土壤样品，根系的总长度仍然很大，如果用人工方法直接测量每段根的长度，然后求出根系的总长度，这种方法需要花费很长时间，如果采用间接的方法，先测量根的直径，然后再测量根的体积，接着求出根的总长度，这种测量方法产生的误差会很大。
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